qes-CATA******qes-PhCqes-CATAADBCEAIBC0−D:12345E ******0 - 300 - 300 - 1000 - 100Mock/MockFosl2/MockMock/c-JunMAP3K8 proLucFosl2/c-JunFosl2/JunBFosl2/BATFFosl2/BATF3Fosl2/c-JunFosl2/JunBFosl2/BATFFosl2/BATF3MAP3K8 proLucFosl2/c-JunFosl2/JunBMAP3K8 proLucFosl2/BATFFosl2/BATF3MAP3K8 proLucFosl2/c-Jun/MockMock/Mock/MockFosl2/c-Jun/TaxMAP3K8 proLucFosl2/c-Jun/TaxMAP3K8 proLucFosl2/c-Jun/Tax0.51.01.52.0Relative luciferase activity0MMPPTTqqeess--AANNRR22LLSSOOFF700700600600500500400400300300200200100100R = 0.91R = 0.9100005050100100150150MAP3K8 RNA-seq TPMMAP3K8 RNA-seq TPM(Nominal p < 0.05)GSEA (MAP3K8 high vs low)Inflammatory responseInflammatory responseUMAPor 5 biologically independent experiments.E MAP3K8 遺伝子座における OCR文献 10)より引用、改変。図 3 MAP3K8 遺伝子の発現誘導機序の探索A UMAP によるクラスタリング B CD4+細胞における MAP3K8 発現 C A one-sided permutation test (1,000 permutations)、 GSEA algorithm に基づき実行された。D ゲノムアクセシビリティ解析 E Pearson correlation coefficient、 n = 13.文献 10)より引用、改変。図 4 MAP3K8 遺伝子の発現誘導機序A Fosl2 ChIP-seq および Tax ChiP-seq B A one-sided hypergeometric test.C、D One-way ANOVA followed by two-sided Tukey's honestly significant difference (HSD) test、 *** p < 0.001、 n = 3, 4、 HAM におけるクロマチン構造異常を介した炎症促進機序の解明と新規治療法の開発39HAM特異的OCRFosl2TaxHAM_9HAM_10MAP3K8(モチーフ解析)HAM特異的OCRMAP3K8特異的OCR(457 bp)(Nominal p < 0.05)(Nominal p < 0.05)Fosl2Fosl2ファミリー: fosファミリーRelative luciferase activityGSEA (MAP3K8 high vs low)Normal CD4+HAM_DTax-cell
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