050523NPOKn01go/lpCIiCICI 05deziradnatSdeziradnatS)Lmgn(RND考 察(D)(G)(c)IgH::CRLF2 株と 1 つの P2RY8::CRLF2 株を含む3 つの Ph-like 株の遺伝子発現プロファイルは、臨床検体で以前に示されたように、BCR::ABL1 株の遺伝子発現プロファイルと重なることが観察されたのは特筆すべき点である 4,5)。さらに、細胞株の有意な発現遺伝子の大部分は、小児 BCP-ALL 症例 341 例の臨床検体の RNA-seq データに当てはめた場合、遺伝子転座のタイプと有意な関連を示したことは臨床的にも重要である。本研究の細胞株バンクは臨床検体の遺伝子発現プロファイルを保持した有用な研究資源であるといえる。 次に、本研究では RNA-seq データを用いて細胞(C)(F)(b)図 7 ACIN1::NUTM1 陽性細胞株 KOPN32 の薬剤感受性解析(B)各細胞株の DNR に対する IC50 値(Y 軸)と HIKESHI の発現レベル(X 軸)を示す。(C)KOPN32 と代表的な遺伝子転座を有する細胞株の HIKESHI の発現レベルを示す。(D)Aza と Dox で処理した ACIN1::NUTM1 誘導亜株における HIKESHI の発現レベルを示す。(E)各化合物の、KOPN32 に対する標準化 IC50 値(Y 軸)と、全細胞株のうち標準化 IC50 値が 10 パーセンタイルに位置する細胞株に対する標準化 IC50 値(X 軸)を示す。(F)診断時または再発時に樹立された細胞株および KOPN32 の AZD7762 に対する標準化 IC50 値を示す。(G)KOPN32 と代表的な遺伝子転座を有する細胞株の AZD7762 に対する細胞生存曲線を示す。The 10th percentile standarized IC50250(B)(E)(a)応答に重要な因子である Chk1 の阻害薬である。実際に、KMT2A-R を含む代表的な融合遺伝子を有する複数の細胞株の AZD7762 に対する感受性を調べたところ、KOPN32 において最も低い IC50値が観測された(=最も感受性が高い)(図 7G)。 RNA-seq デ ー タ の UMAP 解 析 で は、ALL における 8 つの代表的な遺伝子転座を保有する細胞株 80 株が互いに排他的にクラスタリングされ、本解析の感度の高さが証明された。特に、2 つの
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