臨床薬理の進歩 No.47
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(B)(C)図 2 RNA-seq データを用いた細胞株および臨床検体のクラスタリング(次頁につづく)(B、C)細胞株 80 株(B)または臨床検体 341 症例(C)について 51 遺伝子(B)または 48 遺伝子(C)の発現レベルに基づき分類した。最上段に各遺伝子転座を色別に記した。赤(高発現)と青(低発現)のスケールを用いて各遺伝子の発現量を示す。レベルを用いて遺伝子転座をクラスタリングすると、各遺伝子転座が明確に分離された(図 2B)。St. Jude Children's Research Hospital の臨床検体の公開データベース(https://pecan.stjude.cloud/)のRNA-seq データを用いて、小児 BCP-ALL 341 症242の IgH::CRLF2(薄緑色)株と 1 つの P2RY8::CRLF2(茶色)株]の遺伝子発現プロファイルが、臨床検体でも以前に観察されたように、BCR::ABL1(青色)株のものと完全に重なっていた。 同様に、各遺伝子転座に有意な 51 遺伝子の発現(B)(C)

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